We analyzed variation in cytochrome b mitochondrial DNA sequences in 11 subspecies of the Peregrine Falcon (Falco peregrinus), three samples of the Taita Falcon (F. fasciinucha) from Africa, and several other Falco and outgroup species, to assess haplotype diversity in the Peregrine Falcon on a worldwide basis. We identified 16 haplotypes from 31 Peregrine Falcon samples, of which 11 were unique and 5 were shared among two or more subspecies. There was neither concordance between cytochrome b variation and taxonomic designation at the subspecies level, nor any phylogeographic pattern in the genetic data. The Taita Falcon was nested within the Peregrine Falcon clade. Percent sequence divergence between the Taita Falcon and the Peregrine Falcon (0.4–1.2%) overlapped that among subspecies of the Peregrine Falcon (0.0–1.0%), suggesting very close genetic affinity between the two species. We hypothesize that historical and recent dispersal, combined with rapid morphological evolution, contributed to the lack of concordance between variation in cytochrome b mitochondrial DNA sequences and phylogeography in the Peregrine Falcon.

Analizamos la variación en el citocromo b de secuencias de ADN mitocondrial en 11 subespecies de Falco peregrinus, en tres muestras de F. fasciinucha de África y en otros Falco y especies fuera del grupo para determinar la diversidad de haplotipos en F. peregrinus a escala mundial. Identificamos 16 haplotipos en 31 muestras de F. peregrinus, de las cuales 11 fueron únicas y 5 estuvieron compartidas entre dos o más subespecies. No hubo concordancia entre la variación del citocromo b y la designación taxonómica a nivel de subespecie, ni en el patrón filogeográfico en los datos genéticos. F. fasciinucha estuvo anidado dentro del clado de F. peregrinus. La divergencia porcentual de secuencia entre F. peregrinus y F. fasciinucha (0.4–1.2%) se superpuso con la de subespecies de F. peregrinus (0.0–1.0%), sugiriendo una afinidad genética muy cercana entre las dos especies. Hipotetizamos que la dispersión histórica y reciente, combinada con una evolución morfológica rápida, contribuyó a la falta de concordancia entre la variación en el citocromo b de secuencias de ADN mitocondrial y la filogeografía en F. peregrinus.